药学专业于2006年首次招收本科生，经过近10年的建设，办学具有明显的海洋生物医药优势，形成了鲜明的海洋药物办学特色。本专业是浙江省高等学校特色专业，是浙江省海洋生物医药重点学科的支撑专业，建有食品加工与安全农业推广硕士学位点和海洋药学硕士学位点。本专业以“面向需求、突出能力”为专业建设理念，以“教学科研并重、理论实践结合、校企互动协作”为办学思路，依托省重点学科、省特色专业和创新人才培养试验区，以建设服务于浙江省和舟山群岛新区新兴海洋生物医药产业，培养应用创新型人才并达到省内一流、国内先进的特色专业为目标，近十年来，为浙江省乃至全国的药学专业领域培养了近千名的高级专业人才。本专业推行自主化、个性化、实践性、研究性的本科教育新体系，确立“全程导师引导、早期参与科研、分层分类人才培养”的新模式。学生在接受扎实的专业教育的同时，可根据自身素质、能力和爱好，从第二学年开始跟随导师参与药学基础理论研究、新药研发、海洋生物或药用植物的采集与培育等科研创新活动，也可选择在制药企业、医疗机构等校外实践基地接受药品生产技术管理、质量管理和药物临床合理使用等方面的训练。本专业与美国、意大利、日本、新加坡、台湾等国家和地区建立了长期的合作关系，交换生的比例逐年增加。
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