本专业始建于1978年,至今有30多年的历史,是浙江海洋学院办学历史悠久的专业之一,为省重点建设专业。2011年设立农业机械化专业学位硕士点。本专业紧紧围绕地方经济建设,在发挥传统办学优势的基础上,紧密结合船舶工业和临港工业,打造浙江省高水平涉海机械学科平台,强化学生实践教学环节和工程应用性技能,重点培养“涉海机械工程应用型专业人才”。在全国电子设计大赛、机械设计大赛、挑战杯等各类学科竞赛中成绩显著。2016年开始,机械设计制造及其自动化专业与俄罗斯南乌拉尔国立大学开展“4+2”本硕一贯制培养。
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