昌吉回族自治州卫生学校，于1959年02月01日在昌吉挂牌成立，我学校迄今已经成立60年，培养了大量优秀人才，我学校主要经营培养中专学历卫生技术人才，促进卫生事业发展，卫生中专学历教育，医药专业技术开发，医药专业技术培训，相关社会服务，我学校本着制度与人文相结合的管理思想，凭借美丽的校园环境，舒适的住宿条件和优秀的师资力量已成为每年昌吉评价很好的学校之一。
新疆昌吉卫生学校是全国高等卫生职业技术教育协作会常务理事单位、全国医疗卫生信息技术培训与认证指定培训基地、新疆中等职业教育医药卫生专业指导委员会主任单位、新疆中等医学教育研究会主任单位、新疆职业院校思想政治教育研究会副会长单位。是新疆维吾尔自治区建校早的卫生学校之一。2002年新疆昌吉卫生学校获得新疆维吾尔自治区精神文明单位，2003年国家教育部对国家级重点中专复评中，专家组认为新疆昌吉卫生学校在全疆中等职业学校中具有较强的典型示范作用。
1.护理
2.医学检验技术
3.药学
全校现有教职工164人，其中专任教师105人，高级讲师、副主任医师占25%，讲师、主治医师占50%，教师队伍完全实现了理论教师本科化，实验教师大专化。2007年新疆昌吉卫生学校在新疆维吾尔自治区卫生职业学校专业设置评估中取得好成绩；2008年新疆昌吉卫生学校在新疆维吾尔自治区第一批重点中等职业学校人才培养水平评估中取得第一名；2008年、2009年连续两年新疆昌吉卫生学校获得新疆维吾尔自治区护理技能大赛团体一等奖；2009年8月10日新疆昌吉卫生学校获得全国职业院校护理技能操作大赛团体一等奖。