学校设有中文、政史、数理、生化、音乐、美术、外语、体育、计算机科学、初等教育、社科11个教学系（部）30个专业。
| 招收专业 | 学制 | 学校代码 | 名额 | 专业代码 | 招生对象 | 招生地区 |
| 舞蹈表演 | 三年制 | 25 | 140900 | 初中毕业 | 云南省所管辖各市、州、县、区 | |
| 舞蹈表演 | 四年制 | 25 | 140900 | 就读初一、初二的在校生 |
我校的课程设置分三个专业：阿拉伯语专业、宗教专业和波斯语专业。阿语专业包括：精读、商贸口语、听力、语法、词法、修辞、阿语书法等。宗教专业包括：古兰背诵、古兰经注、圣训、信仰、教法、伊斯兰教史、回族史、古兰学、圣训学。波斯语专业包括：精读、语法、口语、听力。
文山州财贸学校先后开设有“会计、会计电算化、计算机网络、电子商务、计算机应用、市场营销、旅游与酒店服务与管理、物业管理、金融事务、房地产营销与管理、网页美术设计、保险事务、医药卫生财会、物流服务”等10余个中专专业、9个专科专业、4个本科专业。
| 专业 | 学制 | 招生对象 |
| 计算机平面设计 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 电子商务 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 计算机应用 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 高星级饭店运营与管理 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 会计 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 旅游服务与管理 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 会计电算化 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 金融事务 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 市场营销 | 中职三年 | 初中毕业生 |
| 类别 | 专业名称 |
|---|---|
| 测绘地理信息类(专) | 工程测量技术 |
| 建筑设计类(专) | 建筑室内设计 |
| 土建施工类(专) | 建筑工程技术 |
| 建设工程管理类(专) | 工程造价 |
| 汽车制造类(专) | 汽车检测与维修技术 |
| 城市轨道交通类(专) | 城市轨道交通运营管理 |
| 护理类(专) |
助产
护理
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| 药学类(专) | 药学 |
| 医学技术类(专) |
口腔医学技术
医学影像技术
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| 财务会计类(专) |
财务管理
会计
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| 教育类(专) | 学前教育 |