1.航海技术专业
航海技术专业培养具有良好的科学、文化素养和高度的社会责任感，基础理论扎实、知识层面宽广、人文底蕴深厚，综合素质高，国防观念强，安全与环保意识好，富有创新意识与实践能力，符合国际公约和国家船员适任标准要求，能够胜任商贸运输和国防需要的持证高级航海技术人才和管理人才。
专业核心课程：航海学、船舶操纵与海上搜救、船舶值班与避碰、航海仪器、航海气象与海洋学、航海英语、海上货物运输、船舶结构与设备等。
就业方向：毕业生既能胜任远洋船舶运输工作，也能胜任航海技术教学科研、航运管理、国防等领域工作。毕业后主要从事国际、国内海洋船舶运输和江海直达船舶运输，也包括航运业务、航海保障、船舶引航、海事管理、航运企业管理、航海院校教学与科研、边防、海关等工作。
2011至2016年的毕业生去向统计：研究生及教育科研机构（20%）、航运企业（50%）、航运技术服务与管理机构及其它（30%）。
2.海事管理专业
海事管理专业定位为浓厚工程背景的公共管理类专业，立足海事安全、航海科学与技术内涵，兼顾公共管理元素，重点突出海事安全监督与保障、水域环境污染防治、港航工程与航运业务等专业内容，适当拓展海事管理的外延，除传统海事管理业务外，还包含港航管理及航运公司安全管理。
本专业通过人文素养、专业知识、实践能力和职业发展能力的专业教育和综合训练，培养适应社会经济发展需要的海事管理高素质专门人才。培养目标为：具备较强的数理基础和科学素养；具备水上交通安全管理、船舶安全运行管理、航海技术、港航与海岸工程、防治船舶污染、通航安全保障、航运业务与法律方面系统的基础理论和基本技能，具有从事海事安全监督与保障、水域环境污染防治、港航工程与航运业务等工作所需的专门知识；具有综合运用交通、信息、管理等多学科基础理论与技术从事海事安全与防污管理、港航工程和航运业务的能力；关注当代航运问题和发展态势，具有创新精神、创业意识和较强创新创业能力；具有较为深厚的人文素养，良好的沟通和写作能力、团队意识和敬业精神。
专业核心课程为：水上交通安全管理、海上交通工程、船舶与港口防污染、水上应急与搜救、船舶引航、港口与海岸工程、海商法、交通信息系统。专业特色课程有：海事安全与风险管理、海事调查与分析、水路危险品运输管理、海洋工程通航评估技术、水上安全保障综合实验、港口管理。
毕业生就业方向主要有：中央直属海事管理和地方海事管理机构、港航管理部门、航海保障部门、港航企业、航运物流公司、航道局及工程局、船舶管理公司、船员培训机构等。
2011至2017年的毕业生去向统计：出国深造（10%）、国内研究生（40%）、海事管理机构（30%）、航运物流及其它相关单位（20%）。