为实现培养目标的达成，生物工程专业的课程设置覆盖了与本专业培养目标和毕业要求相适应的数学与自然科学类课程、工程基础类课程、专业基础类和专业类课程以及人文社会科学类通识教育等课程，并设置了完善的实践教学体系。
专业核心课程包括：普通生物学、生物化学、细胞生物学、微生物学、化工原理、发酵工程、生物反应工程、生物分离工程、生物工程设备。主要实践性教学环节有：工程训练、生物工程课程设计、化工仿真实习、认识实习、生产实习、毕业设计（论文）。
| 专业名称 | 开设学校 | 学制 | 地址 |
|---|---|---|---|
| 生物工程 | 芜湖市地区卫校 | 2 | -- |
| 生物工程 | 武汉市第一轻工业学校 | -- | -- |
| 生物工程 | 沈阳市化工学校 | 四年 | -- |
| 生物工程 | 郑州华信学院 | -- | -- |
| 生物工程 | 河南机电学校 | -- | -- |
| 生物工程 | 毕节职业技术学院 | 2 | -- |
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