巴州卫生学校现开设有护理、助产、卫生保健、药剂、医学检验技术、医学影像技术、中西医结合、中医针灸推拿、眼视光技术等9个专业。
开设机电技术应用、汽车运用与维修、化学工艺、学前教育、计算机应用、网络维护、电工电子、建筑施工、广告设计等10大专业已成为学校的拳头专业，其中机电和汽修专业以成为市示范专业。
