临床医学院设有临床医学、口腔医学、医学影像技术、眼视光技术、口腔医学技术、公共卫生管理等6个医药卫生类专业，其中临床医学、口腔医学专业毕业后可以考取医师资格证，其余专业考取医学技术等相关资格证书。临床医学专业是省内高职高专院校中早获教育部和卫生部批准开设的处方专业，教育部、卫生部批准第一批“3+2”三年制专科临床医学教育人才培养模式改革试点项目。医学影像技术专业是香港华夏基金会资助的短缺优势专业，四川省“高等教育质量工程”专业综合改革项目支持建设专业，中央财政支持建设的特色引领型专业。2012年，临床医学、医学影像技术专业被确定为四川省省级示范建设重点专业。2014年，医学影像技术专业被四川省财政厅、教育厅确定为省级重点专业。2017年，临床医学专业群、医学影像技术与智能医疗装备技术专业群被确定为四川省优质高职培育院校建设特色专业群。2019年，医学影像技术专业被教育部认定为国家级创新发展行动计划骨干专业。
临床医学院重视学生综合素质培养，强化实践技能的训练，不断推进实验、实训及实习基地建设。建成医学影像技能实训中心、临床医学实训中心、眼视光医学实训中心和口腔医学实训中心等校内实训中心，医学临床生产性实训基地被教育部认定为国家级创新发展行动计划生产性实训基地。建成100余个校外实习基地，充分满足各专业学生的实习实训要求。
临床医学院已为雅安及周边地区培养近万名医务卫生工作人员，毕业生质量获得了社会的广泛认可，能较好地适应卫生岗位的要求，受到了用人单位好评,许多毕业生已经成长为各级医院的领导或者业务骨干。
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