安徽财经大学MBA课程结构采用模块化设置，包括入学导向、管理基础、管理能力、人文与职业素养、职业能力与发展、综合管理实践实训、管理前沿与国际视野、第二课堂等八个模块。
1.入学导向模块（2学分）
入学导向
模块 入学教育、拓展训练、职业生涯规划
2.管理基础模块（12学分）
管理基础
模块 社会主义经济理论与实践、管理经济学、数据模型与决策、管理信息系统、商务英语、管理研究方法
3.管理能力模块（22学分）
管理能力
模块 会计学、财务管理、人力资源管理、营销管理、运营管理、战略管理、组织行为学、电子商务、领导学、创新创业管理、企业伦理
4.人文与职业素养15门（任选4门，6学分）
人文与职业素养
模块 中国传统文化与现代管理思想、徽商文化、商务礼仪、管理沟通、演讲与口才、中国商帮、公司治理、创业模拟、金融与地方经济、国际商务管理、数据管理与应用、税收筹划、计量经济方法及应用、宏观经济分析、经济法
5.职业能力与发展模块（选择其中一个模块，并修读其中4门课程，4学分）
职业能力与发展模块 创新创业管理
营销管理
金融投资与管理
财务管理
人力资源管理
物流与电子商务
6.综合管理实践实训模块（3学分）
综合管理实践实训模块 案例编写与分析大赛、创业设计大赛、管理类跨专业综合实验、ERP实训教学（其中案例编写与分析大赛为必选，其他3个项目三选一）
7.学术活动：管理前沿讲座、高级经理人讲座（含徽商大讲堂、MBA新视野讲座）、国际交流与学习等，至少参加6次讲座，2学分。
8.第二课堂包括新徽商读书会、主题沙龙、公益活动、校友论坛、俱乐部、文娱活动等，2学分。
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