1.学科设置。侧重跨学科教学和研究，在数学与应用数学、物理学、化学和生物科学等基础学科及其交叉领域（金融数学、功能材料、海洋资源与环境、生物技术与健康等）开展人才培养和科学研究。“理工创新实验班”本科前两年不分专业，跨学科、重基础培养，后两年按学生志愿和特长分专业培养。
2.国际交流。高等研究院邀请国际知名学者到高等研究院从事教学和研究工作，营造与国际接轨的学术氛围和培养环境。高等研究院支持学生国际交流，资助“理工创新实验班”优秀本科学生暑期赴境外高校访学，选拔并资助“理工创新实验班”优秀本科毕业生申请高等研究院与境外知名高校硕博联合培养项目。
3.导师制。高等研究院所有专职教师均兼任“理工创新实验班”学生学业导师及专业导师，以人为本，因材施教，针对学生个性差异，指导学生学习、研究和生活。
4.奖助学金。“理工创新实验班”所有学生第一年可享有新生全额学费奖学金，从第二年开始，可申请并获得“拔尖创新人才奖学金”、高等研究院出国访学奖学金和助学金等，具体发放办法参照高等研究院奖助学金管理办法执行。
5.科学研究。高等研究院重视学生的本科科学研究素养和探索创新精神，“理工创新实验班”所有学生大三开始进入专业导师实验室课题组，开展为期两年的科学研究工作，培养学生科学研究和实践动手能力。