由招生领导小组按照学科领域分别组织相关专家组成审核小组，对考生的报考材料集中进行学术审核。学术审核重点审查考生的专家推荐书、学习成绩单、学位论文、论文评议书和学位答辩决议书、发表的学术论文、国际国内大型学术会议报告、专利、获奖情况以及申请者的科研经历、研究兴趣、攻读博士学位期间的研究计划等，全面衡量考生的能力和培养潜力，为后续考核环节提供参考。
学术审核结果分为“通过”与“未通过”。“通过”的考生，审核小组还需给出学术审核的分数，评审结果由学术审核小组全体成员签字确认。
学术审核包括六个方面，总成绩为100分。具体内容及成绩占比如下：
1.学术背景（10%）
2.外语能力（10%）
3.专业基础（20%）
4.学术潜力（20%）
5.综合素质（20%）
6.研究计划（20%）
“通过”的考生进入综合考核环节，“未通过”的考生将被淘汰。
对通过形式审核以及学术审核的考生，研究生部将及时发放参加综合考核的邮件进行确认，并在山地所官方网站研究生教育专栏招生信息栏目中公示不少于7个工作日。
2020年中国科学院大学成都山地所博士学位研究生招生申请考核制考生为硕士毕业两年以上，报考类型为非定向者类似问题答案