南京中医药大学选取品牌、特色专业用于综合评价录取，招生计划为学校2020年招生计划总数5％以内。
高考科类 | 专业名称 | 学制 | 计划数 |
文科 | 中医学 | 五 | 3 |
中医学（妇产科学） | 五 | 1 | |
中医儿科学 | 五 | 1 | |
中西医临床医学 | 五 | 3 | |
针灸推拿学 | 五 | 2 | |
中医养生学 | 五 | 2 | |
中医康复学 | 五 | 2 | |
康复治疗学 | 四 | 3 | |
应用心理学 | 四 | 3 | |
理科 | 中医学 | 五 | 6 |
中医学（妇产科学） | 五 | 2 | |
中医儿科学 | 五 | 2 | |
中西医临床医学 | 五 | 5 | |
临床医学 | 五 | 12 | |
针灸推拿学 | 五 | 3 | |
中医养生学 | 五 | 3 | |
中医康复学 | 五 | 3 | |
中药学类（中药学、中药制药、中药资源与开发） |
四 |
27 | |
药学类（药学、药物制剂药事管理） | 、 四 |
18 | |
康复治疗学 | 四 | 7 | |
应用心理学 | 四 | 2 |
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