南科大瞄准学科发展前沿,面向国家及区域战略性新兴产业发展的重大需求,以理学、工学学科为主,兼具医学和特色人文社会科学,在本科、硕士、博士层次办学,在一系列新的学科方向上开展研究。学校现建有29个本科专业,分别是物理学、应用物理学、化学、生物技术、生物信息学、生物科学、数学与应用数学、统计学、理论与应用力学、海洋科学、地球物理学、生物医学科学,共12个理学专业,生物医学工程、微电子科学与技术、光电信息科学与工程、通信工程、信息工程、材料科学与工程、计算机科学与技术、环境科学与工程、水文与水资源工程、机械工程、航空航天工程、智能科学与技术、机器人工程,共13个工学专业,金融数学、金融学、金融工程,共3个经济学类专业,及临床医学1个医学专业。学校将逐步成立理学院、工学院、生命与健康学院、医学院、商学院、人文社会科学学院等,每个学院下设若干个系;通过跨学科交叉,建设26个研究中心。
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