土木工程学科是南昌大学历史悠久的学科之一，始于新中国建国前的中正大学土木系（后改为南昌大学），留美学者蔡方荫先生（中科院院士）曾担任系主任。1958年江西工学院成立时，土木建筑工程系重新创立，当年开始招收工业与民用建筑专业本科生。1999年，工业与民用建筑专业更名为土木工程专业，并增设道路桥梁专业方向。2019年增设城市地下工程方向。1999年土木工程专业被江西省教育厅评为江西省品牌专业。2008年，土木工程专业被江西省教育厅评为江西省特色专业。2010年，土木工程专业首次通过住房和城乡建设部的专业评估，2015年复评并获优秀通过，是江西省首次通过住建部评估并连续两次以优秀成绩通过专业评估的专业。2011年土木工程专业列入教育部卓越工程师人才教育培养计划，2019年入选国家一流本科专业。现有班级34个，学生总数1100人左右。
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