基础教学中心是主要负责全校基础课课程教学的院级单位，成立于2000年4月，由计算机基础部、教育系、体育系、艺术系和心理健康教育与咨询中心等5个教学科研单位组成。中心拥有一支综合素质高、教学科研能力强、结构合理、具有多学科背景的师资队伍。各系学科带头人具有深厚的专业理论功底，在学术研究、教学实践和服务地方经济社会发展等方面积累了丰富的经验。目前设有“音乐文学”二级学科硕士点，“教育硕士”、“体育硕士”专业学位点。
教育硕士专业学位点下设教育管理、学科教学（英语）、现代教育技术、职业技术教育4个二级学科。
音乐文学是一个建立在一级学科“中国语言文学”之下，以音乐与文学的渗透融合为主要内涵，以跨专业结合研究为特色的二级学科，主要研究音乐文学的特征和规律。音乐文学硕士点包括音乐文学理论、音乐文学创作、音乐文学与音乐表演3个学科研究方向。
体育硕士专业学位的培养目标是培养具备扎实体育专业知识、能够独立承担体育专业技术或管理工作的、高层次应用型人才。体育硕士专业学位在招生办法、教育内容、培养模式、质量标准等方面突出与体育相关的职业要求，注重实践性与职业性的紧密结合。体育硕士专业学位的培养将充分吸收学校的海洋研究资源，将体育人才的培养与海洋发展特色相结合，以帆船等海上运动项目为特色，建立面向海上运动发展的体育硕士专业学位人才培养体系。中国海洋大学体育系于2004年建立运动训练本科专业、2006年建立体育教育训练学硕士点、2015年获批中职教育（体育）硕士点，2017年获批体育专业硕士点，至今已招收本科生490余人，在校生150余人；培养研究生89人，在读26人，招生规模与办学条件均得到了稳定发展，建有包含运动生理、生物力学、生物化学、运动心理学等7个实验室在内的体育实验中心1个。 “体育硕士”专业学位点下设体育教学、运动训练2个二级学科。