清华大学历史学科有着悠久传统和辉煌历史，是中国“新史学”的发源地之一，著名学者王国维、梁启超、陈寅恪、蒋廷黻、刘崇鋐、雷海宗、张荫麟、邵循正、吴晗、周一良等都先后在历史系执教，形成了中西融汇、古今贯通的学术传统，培养了诸多蜚声中外的学者。20世纪80年代以后，清华大学逐渐恢复包括历史学科在内的人文学科。1985年，成立思想文化研究所，1993年重建历史系，2003年所、系合并形成新的历史系。2000年，历史系获批专门史博士点，2006年，历史学获得一级学科授予单位，2007年，建立历史学博士后流动站，同时专门史二级学科成为国家重点学科。2008年，成立出土文献研究与保护中心。2012年，由清华大学牵头，联合国内11个高校与科研机构，共同建立了“出土文献与中国古代文明研究”协同创新中心，2014年，该协同中心通过了教育部的正式认定。如今的清华大学历史系,学术梯队合理，学科齐全，优势集中，特色明显，学术新生长点多，已成为国内历史学科中一支举足轻重的力量。
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