各学院按照保证招生质量、尊重导师招生自主权和排除非学术因素干扰的基本原则，结合自身学科特点，制定初选、复核及确定拟录取名单的具体操作办法，学院申请审核制工作办法经研究生院审核批准后实行，并在学院主页上公布。
1.初选
在考生提交材料截止日期后，学院组成资格审核学科专家组（专家组的成员原则上为博士生导师，一般不少于5人），根据申请人所提交的申请材料，对其科研潜质和基本素质进行初选，综合初选结果和招生导师的基本意向，提出进入复核阶段的考生名单，并报送研究生院统一公布。
2.英语入学考试
英语水平未达到免试要求的申请者，但符合上述参加学校英语统一考试条件者，需参加学校统一组织的英语入学考试，考试成绩达到学校划定的合格分数线后，可视为英语水平考核通过。
3.提交纸质申请材料
进入复核名单的考生，在参加复核时将所有盖章、签字的纸质材料原件交到学院审核，学院审核后留复印件备查，申请材料包括：
（1）本人签字的《南京农业大学博士生报名登记表》（见附件1）。
（2）本人有效身份证和学生证（往届生不提供学生证）。
（3）学位、学历证书（应届毕业硕士生提交所在单位研究生管理部门的书面证明）。
（4）英语水平证书或成绩单。
（5）获奖证书、课题、发明专利、已发表（录用）论文等的原件或其它可以证明考生科研能力和水平的证明材料。
（6）硕士学位论文（应届毕业硕士生可提供论文开题报告、论文摘要和核心研究内容等）。
（7）拟攻读博士学位的科学研究计划（见附件2，不少于3000字，由学院做具体要求）。
（8）下载并填写《南京农业大学报考攻读2019年博士学位研究生思想政治品德考核表》（见附件3），定向生加盖所在单位党委系统公章，未就业人员加盖档案保管单位公章，应届生加盖所在学院党委公章。
（9）两名所报考学科专业领域内副教授（或相当于副教授)及以上职称专家推荐书（见附件4）。
（10）通过网上报名系统打印的《博士学位研究生网上报名信息简表》（注：本表中“本人自述”部分请空白）。
4.复核及体检
学院按学科或研究方向组成专家组进行复核工作，对进入复核阶段的考生进行专业能力审核，包括专业基础知识考查与综合能力面试两个环节。
专业知识考查可根据各学院特点通过笔试、面试及实验操作等形式进行。综合能力面试时对考生的本科、硕士期间学习、科研能力、英语水平(含文献阅读、摘要写作、口语和听力等）、专家推荐、拟攻读学科博士学位的研究设想等情况进行综合审核。
复核具体时间、地点、要求原则上应提前7天在学院主页公布，面试工作应公开进行。综合审核时，考生须准备本人有效身份证、学生证、本科及硕士毕业证书、学位证书、英语水平证明及发表论文等材料的原件备查。
考生需参加南京农业大学校医院组织的体检，体检安排由各学院根据本院的复核阶段的时间安排与校医院商议决定，并另行通知。体检时务必携带下载、打印的体检表（见附件5，正反两面打印）。
5.确定并报送复核成绩
复核总成绩由四个部分组成：英语、业务课一、业务课二和面试成绩。复核总成绩排名是确定录取排名的依据。各学院在制定方案时要明确规定各部分的考核方式，给分办法及复核总成绩中每部分的权重。
6.确定拟录取名单并公示
在结合导师招生资格及名额的基础上，根据申请人的复核总成绩排名，确定拟录取考生名单，并报送研究生院。