1.学校设立“校长特别奖学金”（一等奖100000元，二等奖50000元），每年评审1次，不限名额和奖励次数，只要符合申请条件的非定向博士研究生均可申报获得；
2.学校针对非定向博士研究生设立研究生学业奖学金、国家助学金等支持研究生完成学业。（1）第一学年将获得学业奖学金14000元和国家助学金13500元；（2）其它学年学业奖学金通过评定发放，奖金分别为18000元（20%）、14800元（50%）和10000（30%），国家助学金13500元保持不变；
3.非定向博士研究生可以申请国家奖学金，国家奖学金奖励标准为博士每生每年30000元；
4.非定向博士研究生还可以申请企业、社会团体和个人在我校设立的研究生奖、助学金；
5.非定向博士研究生（不含留学生），在规定学制内，导师给予的助研津贴不低于每生每年5000元。
6.学校每年将投入一定经费，作为博士生勤工助学基金。面向博士研究生设立研究生助教、助管岗位。
7.对家庭经济困难和在校学习期间因其家庭或本人遭遇特殊灾害或发生突发性重大事故、疾病等原因而产生的临时生活困难的博士研究生，学校将采取综合减免学费、发放特殊困难补助等方式，加大资助力度。
具体内容详见《南京林业大学研究生奖助学金体系改革实施方案（试行）》。