1.专项奖学金：本硕阶段（第一年）奖励5000元，硕、博阶段（第二、三年）分别奖励10000元。每生累计可获专项奖学金2.5万元。
2.常规奖、助学金：根据上海海事大学研究生奖、助学金管理办法实施，同时鼓励导师给予本硕博学生助研津贴。
3.国际交流奖学金：课程学习结束后，学生可以申请国际交流和访学，根据交流和访学的时间及目标，可获5000-50000元的国际交流奖学金。鼓励学生国外访学一年。
４.学费：硕士学习阶段按硕士生学费标准缴纳；博士生学习阶段按博士生学费标准缴纳；本硕阶段免交学费。
５.本硕博连读生在校学习年限不得少于5年,本硕博连读期间不得兼职。