1.坚持公开、公平、公正，德、智、体、美全面衡量，择优录取，宁缺毋滥的原则。坚持学院招生工作领导小组和审核小组集体决策的原则。坚持以考生的创新能力、科研潜力和已获得的学术成果为依据的原则。
2.建立科学有效的选拔机制，进一步增加博士生导师在选拔过程中的自主权，发挥博士生导师在博士研究生招生中的主导作用，选拔具有创新能力和学术专长的拔尖创新人才。
2018年南开大学生命科学学院博士研究生“申请-考核制”招生选拔实施细则学校成立争议委员会，负责解决考生在招生中的申诉类似问题答案