●在泉州校区报到的学院(福建省泉州市丰泽区城华北路269号)：经济与金融学院、法学院、JM教育中心、政治与公共管理学院、MPA教育中心、体育学院、文学院、外国语学院、数学科学学院、生物医学学院（分子药物研究院）、工学院、工商管理学院、MBA教育中心、旅游学院、MTA教育中心、美术学院等16个学院（中心）。
●在厦门校区报到的学院(福建省厦门市集美区集美大道668号)：哲学与社会发展学院、统计学院（数量经济研究院）、国际关系学院（华侨华人研究院）、海上丝绸之路研究院、马克思主义学院、华文学院、华文教育研究院、新闻与传播学院、机电及自动化学院、材料科学与工程学院、信息科学与工程学院、计算机科学与技术学院、建筑学院、土木工程学院、化工学院、音乐舞蹈学院等16个学院（研究院）。