1．了解微生物生态学概念、微生物生态系的结构和功能。
2．了解微生物在自然界中的分布。何谓极端微生物?了解古菌（Archaea）和极端微生物的关系。
3．了解微生物间和微生物与其他生物间的5种主要关系。
4．了解微生物在自然界碳、氮、硫、磷物质循环中的作用。
5．何谓水体富营养化、生物处理（Biotreatment）和生物整治（Bioremediation）?。解释“水华”（WaterBloom）、“赤潮”（RedTide）现象。说明微生物在环境保护中的作用。
6．了解16SrRNA等基因在分子微生物生态学中的重要意义以及基于这类生物分子发展起来的分子微生物生态学的基本方法。