德国研究中心与北京大学校内上述院系进行合作，共同实施本培养计划。各有关院系为德国研究中心招收硕士研究生，并负责学籍管理和学位授予等工作。在中心项目注册的硕士研究生首先应当完成其所在院系专业培养方案所要求的基本课程，并同时学习中心提供的课程。培养计划的指导教师为来自以上各院系的德国研究中心成员，或为受相关院系委托的德国研究中心成员。
德国研究中心同时与德国合作大学进行合作，共同实施本培养计划。合作方式为：中心的硕士研究生第一学年同时学习其所在专业的课程与中心提供的课程；第二学年赴对口的德国大学(原则上均前往柏林自由大学及柏林洪堡大学)，在相关专业德国教授的指导下学习相关专业课程，同时为硕士论文搜集材料和进行准备；第三学年返回北京大学，完成其硕士论文。
在德学习期间，中心学生将获得额度为670-750欧/月的奖学金，奖学金金额基本可以负担日常生活学习所需费用。中心协助每位赴德学生联系其所在专业的德国导师，通过与导师的交流，学生能够极大地提高个人专业素养和学术能力。此外，中心在柏林还设有办公室并派驻相关人员，负责照顾中心全体赴德学生的生活与学习，并专门为学生组织各类丰富有趣的体验活动，如参观联邦议会、观剧、集体出游等。
参加以上联合培养计划的中心学生需符合以下条件：
1.赴德前修满培养计划中所要求的全部学分；
2.赴德前参加德福考试并取得符合要求的成绩：德福考试各项单项成绩不低于4分，总分不低于16分；
3.积极参加中心举办的各项课外学术活动。