湖南城市学院生物工程专业以生物学为基础学科，培养掌握微生物发酵工程、生物产品制备工艺及天然产物提取技术等生物科学基础理论、基本技能和技术应用知识，能在生物发酵、生物化工、医药食品、能源环保等相关企事业单位，从事产品研发、管理销售、检测分析、质量监控等工作的高素质应用型人才。本专业现有专业基础课程及专业课程教师24人，其中具有高级职称人员9人，博士及在读博士13人，省级学科带头人、青年骨干教师等各类人才5人。
本专业现有价值330余万元的先进教学仪器设备，拥有“黑茶金花湖南省重点实验室、黑茶发酵及功能成分提取技术湖南省应用基础研究基地、湖南省高校黑茶发酵工艺与质量控制关键技术产学研合作示范基地、湖南省生物工程专业校企合作人才培养基地”等各级平台10个，先后与湖南益阳茶厂有限公司、美国科罗拉多州立大学动物癌症中心、美国WH健康中心等开展了广泛的国内外合作与交流，并与省内多家知名企业建立了密切的人才培养合作关系。
本专业人才培养以服务地方经济为宗旨，在200余名各届毕业生中，年度就业率均保持在99.5%以上，其中50余人考取了国内知名高校的硕士研究生，考研率达30%，居全校各专业前列。
