蒙古学学院是呼伦贝尔学院早成立的具有民族特色和地区特色的院系之一。始建于1977年12月（原海拉尔蒙师大专班），至今有41年的历史。2003年升入本科教学阶段。四十多年来，先后有24届专科毕业生、10届本科毕业生，为呼伦贝尔市以及内蒙古自治区社会、经济、文化发展培养和输送了3000多名少数民族应用型人才。
现有专兼职教师共30名，其中教授5人，研究员1人，副教授4人，副研究员1人；具有博士学位的教师5人，具有硕士学位的教师15人。在主讲教师中博士硕士比例达到83%。
现有中国少数民族语言文学、社会学、秘书学等三个蒙语授课本科专业，并设置了语言文学系、双语教育系、社会学系、秘书系等4个教学系。蒙古学学院科研教研成果丰硕，2003年升本以来公开发表了200多篇论文，其中国家级核心刊物上发表论文80多篇，并参与编写了《现代蒙古语》、《中古蒙古语》、《写作》、《文学概论》、《中国蒙古族当代文学》、《外国文学史》、《应用文写作》、《比较文学》、《蒙古文电脑操作知识》、《蒙古文书法指导》、《班主任工作技能》、《教师口语》等十几部高校教材, 《鄂温克民族文化民俗研究》《中世纪蒙古文宗教文献比较研究》、《蒙古族当代文学发生研究》、《蒙古民歌研究》、《哈穆尼堪鄂温克研究》、《陈巴尔虎风俗研究》、《蒙古族、达斡尔族人与异类婚配型故事比较研究》等专著以及《鹏程》等史料文集。蒙古学学院中国少数民族语言文学（蒙古语言文学）专业为呼伦贝尔学院重点建设学科，鄂温克、达斡尔、鄂伦春三少民族语言文化研究为特色研究学科。
学院教师在呼伦贝尔市“三少”民族和巴尔虎、布里亚特、厄鲁特蒙古族特色方面具有学术优势。国家级科研项目有4项，校级重点项目有2项，已经完成的和目前参与的省部级科研项目有7项。 “三少”民族语言文化研究所加强与国内外有关科研机构的交流合作，研究人员先后参加了第一、二届国际通古斯语言文化学术研讨会（海拉尔）、第八届国际蒙古学大会（乌兰巴托）、国际游牧文化研讨会（乌兰乌德）、内蒙古大学第四次国际蒙古学学术讨论会（呼和浩特）、中国蒙古学首届和第二届国际研讨会（呼和浩特）、协办了第二届东北亚语言文化经济国际研讨会（海拉尔）和内蒙古民俗学会第九届学术研讨会（海拉尔）等国际性学术会议。
先后邀请40多位国内外专家学者来进行学术交流和学术讲座，其中有匈牙利科学院的霍帕尔博士，俄罗斯布里亚特共和国的萨彦博士，蒙古国科学院的桑布乐登布院士、策?乌尼日巴音博士，中国社会科学院的朝克博士，黑龙江大学满语研究所的哈斯巴特尔博士，内蒙古大学蒙古学学院院长、全国政协委员白音门德教授（博导），内蒙古师范大学社会学民俗学学院敖其教授等知名学者和鄂温克族著名作家乌热尔图先生，研究《蒙古秘史》的达斡尔族著名学者阿尔达扎布，鄂伦春族著名学者孟松林先生等到学校举办讲座和进行学术交流。
蒙古学学院和“三少民族”语言文化研究所所取得的学术成果先后荣获内蒙古自治区第一、第二届哲学社会科学优秀成果政府奖二、三等和全区民族教育研究成果奖。蒙古学学院被评为呼伦贝尔学院2004-2005学年度科研工作先进集体、呼伦贝尔市2005年度学习和使用蒙古语文先进集体、呼伦贝尔市2008年度学习使用蒙古语文先进集体。2012年3月全市学习使用蒙古语文先进集体、蒙古学学院党总支2016年7月被评为内蒙古自治区高校先进基层党组织奖。2017年9月获校级《民族团结先进集体奖》。
面向全区招生，有蒙古语言文学、语文教育、社会学、秘书学专业的本科在校生420人。2005年以来，先后派送27名学生赴蒙古国东方省东方学院交流学习，并向内蒙古师范大学选派11名大学生委托培养，毕业生就业率达到95%以上。学院积极优化和调整专业结构和人才培养方案重视并加强学生的技能训练，致力于为民族地区培养少数民族应用型人才。
教师资料室图书文献数2820册,总价值66000元，其中蒙文图书898种，1610册，占总图书的58%，长期订阅报刊杂志24种，累积期刊杂志数861册，价值6200余元。现有教学科研仪器设备和实验室资产价值100余万元。
2018年招生专业：中国少数民族语言文学（蒙） 社会学（蒙）秘书学（蒙）
1.中国少数民族语言文学（蒙）：
本专业旨在培养具有较高综合素质，能适应社会需求的中小学蒙语文教师、行政单位公务员、翻译工作者以及在企事业单位工作的应用型人才，该专业为师范类专业。
主要课程：文学概论、蒙古族文学史、蒙古史、美学、写作学、语言学概论、现代蒙语、现代汉语、中国文学史、外国文学、蒙汉翻译学、汉语应用文写作，普通话训练、基里尔蒙古文、游牧文化等。
中国少数民族语言文学专业招90名，新生入学后，根据学生的自愿计划分成3个不同就业方向的教学班级。
2.社会学（蒙）：
本专业培养适应民族地区社会、经济、文化建设发展需要，主要培养具有较全面的社会学和民俗学理论基础知识、学科素养和实践能力的科研机构、中小学、文物馆、博物馆、影视文化事业单位、社会团体和民间组织从事与社会学、民俗学、人类学相关岗位工作的应用型人才。
主要课程：民俗学概论、社会学概论、蒙古族民俗、人类学概论、民族学概论、蒙古族民间文学、非物质文化遗产学、北方民族史、外国社会学理论、文化人类学、普通话训练、蒙古国基里尔文字等。
3.秘书学（蒙）：
本专业旨在培养系统掌握文秘和办公管理的基本理论和知识，具有较强的学习能力、工作能力和创新能力，适应区域经济社会发展需求的，生产、管理服务一线文秘工作者，在相关学校及培训机构从事文秘教育教学工作的应用型人才。
主要课程：现代蒙语、应用文写作、秘书学概论、 档案管理学、文书学、办公自动化、汉语写作、翻译学、外国文学、公共关系学、现代管理学、行政管理学、蒙古文信息处理、秘书礼仪等。
